受访单位供图
深圳晚报讯 （深圳报业集团记者 刘夏蓝） 近日，南方科技大学生命科学学院郭红卫讲席教授团队与合作者在顶级期刊Cell发表题为“A spatiotemporal lifecycle atlas decodes spatial coordination in rice”的研究论文，构建了覆盖水稻“种子到种子”全生命周期的3D单细胞时空图谱，为理解水稻发育中细胞类型、空间结构与调控网络的协同关系提供了重要框架。
研究团队依托华大时空组学技术Stereo-seq，结合单核RNA测序（snRNA-seq）及AI驱动的发育轨迹分析和水稻单细胞基础模型RICE scGPT，构建了覆盖水稻“种子到种子”全生命周期的3D时空细胞图谱，进而从单细胞和空间维度阐明了水稻发育过程中细胞命运、组织发育与基因调控的动态耦合机制。
为促进数据开放共享与领域协作，研究团队搭建了Rice Spatio Temporal Atlas交互式在线平台，并研发出水稻单细胞基础模型RICE scGPT。该模型以本研究数据与公开水稻单细胞数据为训练基础，可辅助鉴定缺乏明确标志基因的细胞类型，并支持不同来源数据集的快速整合，从而提升水稻单细胞研究的可比性与可复用性。
